Přírodopisná sbírka obsahuje předměty převážně mineralogicko- petrografického a paleontologického charakteru. Minerály a horniny jsou zastoupeny množstvím vzorků z Ivančic a okolí, ve větší míře například ze sedimentárních štěrko- pískových teras, v nichž se nacházejí dokonce i gravitačně transportované jurské křemité geody z Rudic. Paleontologická kolekce je početně malá, ale velmi kvalitní. Jsou zde zastoupeny velké otisky kapradinovitých, plavuňovitých a přesličkovitých rostlin, které pocházejí z permokarbonských sedimentů jižní části boskovické brázdy, konkrétně z Rosicko- oslavanského uhelného souvrství. Z fosilní fauny se zde nachází otisky ryb a mlžů. Několika exempláři jsou zastoupeny také předměty pocházející z Ekvádoru (např. lebka kajmana, taška z kůže pásovce, tsantsa). Zajímavostí jsou i lidské lebky pokryté minerálem brushitem.