Archeologický fond dokládá kontinuální osídlení regionu od starší doby kamenné po celé období pravěku, středověku až po novověk. Bohaté osídlení v době bronzové dokládají např. žárové pohřebiště z Tetčic, sídliště z Budkovic, osídlení z doby halštatské zase sídliště z Rajhradu. Hojně jsou ve sbírkách zastoupené doklady středověkého osídlení Ivančic. Významné působení Jednoty bratrské v Ivančicích ilustruje početná kolekce archeologických artefaktů z lokality Sbor, stavební vývoj centra města v době vrcholné gotiky a renesance zase výzkum tzv. staré radnice. Mezi zajímavosti fondu patří unikátní kolekce kamnových kachlů, povětšinou pocházejících z produkce místních dílen. Nejnovějším obohacením fondu je například nález zcela dochovaného meče s číškovitou rukojetí z doby bronzové.